Fen Bilimleri Enstitüsü’nün stratejik amaç ve hedefleri eğitim, araştırma, insan kaynakları ve kurumsallaşma, paydaşlarla ilişkiler, uluslararası ilişkiler olmak üzere beş ana başlık altında belirlenmiştir. Bu kapsamda yapılacak faaliyetlerin amacı nitelikli öğretim elemanı ve öğrenci yetiştirmek, nitelikli bilimsel yayın ve proje sayısını artırmak, araştırma çıktılarını toplumsal ve ekonomik faydaya dönüştürmek, paydaşlarla ilişkileri güçlendirerek makro ve mikro düzeyde politika kararlarında faydalı olabilecek faaliyetler yürütmektir. FBE’nin stratejik amaç ve hedefleri detaylı olarak aşağıda verilmiştir.

Amaç 1. Eğitim-öğretim kalitesini artırmak ve uluslararasılaşmayı sağlamak.

Hedef 1.1. Eğitim-öğretim düzeyini geliştirmek ve sürdürülebilirliğini sağlamak.

Hedef 1.2. Enstitüyü başarılı öğrenciler için tercih edilir düzeye getirmek.

Hedef 1.3. Çok disiplinli çalışmaları teşvik etmek.

Hedef 1.4. Uluslararası bilimsel etkinliklere katılımı teşvik etmek.

Hedef 1.5. Uluslararası öğrenci sayısını arttırmak.

Amaç 2. Girişimcilik faaliyetlerini geliştirmek ve yaygınlaştırmak

Hedef 2.1. Araştırma, geliştirme ve inovasyon süreçlerine, öğretim elemanı, öğrenci ve mezunların katılımının zemini olan Konya Teknokent’in etkinliği desteklenecektir.

Amaç 3. Sosyal sorumluluk bilinci, hizmet kalitesi ve paydaşlarla iş birliğini arttırarak topluma katkı sağlamak.

Hedef 3.1. Toplumsal katkı doğrultusundaki faaliyetler yerel, bölgesel ve ulusal kalkınma hedefleriyle uyumlu bir şekilde yürütülerek topluma katkı sağlayacak etkinlik sayısı artırılacaktır.

Amaç 4. Ulusal ve uluslararası normlar çerçevesinde kurumsal yapıyı güçlendirmek.

Hedef 4.1. Öğrenci, mezun, akademik ve idari personelin kurumsal aidiyet duygusunu güçlendirecek etkinlik ve uygulama sayısı artırılacaktır.

Hedef 4.2. Kalite güvencesi sistemi süreçlerinin sürekli izlenmesi, ölçülmesi ve iyileştirilmesi sağlanarak iç ve dış paydaşların katılımı artırılacaktır.